良太郎一行人为了追踪异魔神而回到过去，但他们却不知道自己已经落入了牙王的圈套。当良太郎等人消灭完异魔神并想回到电王号的时侯，却发现电王号已经被牙王所劫持…… 　　众人被迫留在过去，但最坏的情况发生了。良太郎失去了成为电王的所有记忆，桃塔罗斯也因此不能附上良太郎的身体。在机缘巧合下，良太郎遇到10岁时的自己和异魔神齐格，并且在樱井的帮助下，开始了追踪电王号之旅。 　　另一方面，回到江户时代的牙王成功夺得神之列车牙王号，并抓住了追来的良太郎，他坐着牙王号回到了1988年12月26日。　　在1988年，良太郎恢复了记忆，但却被牙王阻挠而不能变身。正当此时，樱井带救兵出现，而救兵竟是三个不同时间线里的良太郎。于是，四个不同形态的电王同时出现，最精彩的战斗即将展开……

早在八百年前，人类的欲望催生出21枚核心硬币。凡是得到硬币的人，必将获得巨大的力量。2011年6月，德国图林根州，鸿上基金会的会长鸿上光生率领探险队深入图林根州某森林的腹地，经过不断地勘测和挖掘，终于找到了核心硬币的埋藏点，却无意间解开了尘封数百年的封印，而且也使森林和东京的新宿发生对调。伴随着巨大的变动，无数中世纪士兵从山洞中走出，展开残酷的杀戮。偶然路过附近的火野映司与泉信吾卷入混乱，与武士们展开战斗。在武士的身后，是有着强大能力的炼金师盖拉，她复活后发誓成为新世界的主宰——奥兹（OOO）。混乱中，所有的人都被卷入德川八代将军吉宗所在的江户时代……

某一天，一颗陨石坠落地球，引发不可思议的时空扭曲。穿越时空隧道出现的，是来自40年后的未来假面骑士波塞冬（滨田贤二 饰）。与其它伙伴相比，这是一个好战求胜的战争狂，他发誓要打败所有现代的假面骑士。以此为契机，火野映司（渡部秀 饰）、后藤慎太郎（君岛麻耶 饰）和伊达明（岩永洋昭 饰）暂时告别普通人生活，挫败波塞冬的野心，并救回失踪良久的安库（三浦涼介 饰）。与此同时，邪恶组织财团X利用陨石带来的宇宙生命之种展开邪恶计划。为了保卫地球和宇宙，史上最强大的假面骑士部队集结于此……本片为假面骑士系列40周年纪念作品。

高中生夏目本来可以拥有平凡的高中生活，但是，他却能看到妖怪，并因此而苦恼。很多次，他都差点被妖怪夺去性命。 一次偶然的机会，夏目巧遇猫神。猫神告诉他，夏目的外婆玲子有一本“友人帐”上面记录了所有被玲子打败的妖怪的名字，玲子死后，妖怪为夺回名字，才纠缠夏目。只有把妖怪的名字还给他们，夏目才能恢复宁静的生活。 为了回到宁静的生活，夏目与猫神拿着“友人帐”开始了寻妖之旅，一段段关于妖怪的感人故事，就这样被引出。

高中生如月龙司由于父母远在海外过着平静的独居生活。但是，表姐英理子从国外回来后，他的生活就此发生了改变。与黑暗组织“毒牙”的接触、与谜之美少女萝丝的相遇。萝丝居然被判定为了传说中的红龙！而且，萝丝对理应是初次见面的龙司一见钟情！？更糟糕的是，盯上了萝丝和遗物“Lost Precious”，不断出现他们面前的各种人物是……少女萝丝和龙司的故事就此展开！！

与异魔神作战的假面骑士欧兹遇到了乘坐时间列车电王号来到现代的新电王。异魔神逃往了1971年11月11日，幸太郎和泰迪追了过去，映司和安库也一同上了列车。在过去的时空里，幸太郎变身成新电王打倒了异魔神，然而谁都没有察觉到安库不小心弄丢了一枚细胞硬币。映司一行人回到了2011年4月1日，发现日本已经被邪恶集团修卡给统治了，而且修卡最强的改造人竟然是假面骑士1号和2号。原来历史会发生改变正是由于那枚丢失的硬币。修卡的科学家用核心硬币造出了修卡硬币，修卡硬币吸收了安库丢失的细胞硬币后，诞生出了强大的修卡贪欲者，他打败了假面骑士1号和2号，并给1号和2号洗脑，此后再无新的正义假面骑士出现。为了修复历史，消灭邪恶力量，时间列车再度驶往过去，映司则单独留在现代与怪人们作战，他们将一同保护假面骑士的历史。

负塔罗斯军团联手牙鬼族袭击了银行，还偷走了电王的通行证，妄图统治全世界。为了打倒恶徒，时间列车分局成立了，桃塔罗斯等人干劲十足地开始了调查。警视厅派来了铃木刑警负责此案，铃木是个很胆小的警察，让良太郎他们哭笑不得，但又不得不协助他的工作。铃木执着于立功，独自一人潜入负塔罗斯军团的秘密基地，不料中了圈套。前来救他的良太郎等人也不幸中了陷阱，但好在成功逃脱。而此时，负塔罗斯军团已经向国会议事堂发起了进攻。为了阻止他们，假面骑士电王与月骑强强联手，击败邪恶。

钢铁武士为了保护艾美拉娜公主被人工星球囚禁在星球内部。赛罗奥特曼、火焰战士还有镜子骑士为了救他们也进入到了这个人工星球内部。在人工星球移动的过程中，被雷和日向撞见，于是雷和日向也进入到了这个星球内部。这个人工星球叫比特星球。星球内部为空洞，星球的中心有人造太阳，在其公转轨道上有月球。星球内的外壳内壁上有未来建筑物的废墟，再向内部延伸有岩石山体与干涸的海床。星球内部没有人，比特星球穿梭各个宇宙，它出现的地方会发生重力异常。比特星球的在內部造了大量的机器人军团，其目的是抹杀一切有机生命体。赛罗他们为了救出困在里面艾美拉娜公主，而与机器人军团相遇。不过非常糟糕的是，钢铁武士被比特星球控制，甚至还出现一台非常厉害的机器人钢铁杀手，连赛罗奥特曼都难以招架。要想救出被困的公主还有钢铁武士，众人必须找出幕后黑手才能阻止这一切。

钢铁武士为了保护艾美拉娜公主被人工星球囚禁在星球内部。赛罗奥特曼、火焰战士还有镜子骑士为了救他们也进入到了这个人工星球内部。在人工星球移动的过程中，被雷和日向撞见，于是雷和日向也进入到了这个星球内部。这个人工星球叫比特星球。星球内部为空洞，星球的中心有人造太阳，在其公转轨道上有月球。星球内的外壳内壁上有未来建筑物的废墟，再向内部延伸有岩石山体与干涸的海床。星球内部没有人，比特星球穿梭各个宇宙，它出现的地方会发生重力异常。比特星球的在內部造了大量的机器人军团，其目的是抹杀一切有机生命体。赛罗他们为了救出困在里面艾美拉娜公主，而与机器人军团相遇。不过非常糟糕的是，钢铁武士被比特星球控制，甚至还出现一台非常厉害的机器人钢铁杀手，连赛罗奥特曼都难以招架。要想救出被困的公主还有钢铁武士，众人必须找出幕后黑手才能阻止这一切。

贝利亚军团被毁灭后，赛罗奥特曼与火焰战士、镜子骑士、钢铁武士组成了“终极赛罗警备队”。现在他们准备再次拜访艾美拉娜公主。因为钢铁武士等不及面见公主殿下，所以他就率先出发了。没想到等赛罗、火焰战士、镜子骑士赶到的时候，却发现钢铁武士抱着公主殿下的飞船，被神秘星球给抓住了。另一边，雷与日向船长驾驶飞船前往行星布拉姆，准备去海边度假。没想到在飞行的路上，眼前突然出现了之前赛罗他们遇到的神秘星球。日向船长拜托熊野队员帮忙调查这颗星球的情况，随后雷和日向船长驾驶飞船潜入了星球的内部。在星球内部雷和日向遇到了艾美拉娜公主，艾美拉娜公主警告雷和日向会有危险，可是雷和日向没有听到。结果雷和日向的飞船就遭到了神秘机器人的袭击。千钧一发之际，赛罗奥特曼、火焰战士还有镜子骑士出现了，解决了眼前的危机。

位于东京的东都线地铁开通当日，一起针对东京都知事朝仓优一郎的炸弹袭击事件爆发，导致东都线列车损毁。经过一番推理，江户川柯南等人认定这次的事件与8年前朝仓优一郎主持负责的北之泽水坝的修建有关。当年为了修建大坝，朝仓动员北之泽村的人民搬入新村，可是仍有许多人反抗到最后阶段不愿搬迁。为了探明事情的真相，柯南、灰原、少年侦探团以及毛利小五郎等人开车前往白雪皑皑的北之泽。在这片纯净的雪国，少年们尽情玩耍，与此同时他们也遇到了几名原北之泽村的村民，山尾、远野、立原等人。他们是从小一起长大的好朋友，而彼此之间似乎又有着某种芥蒂和秘密。立原的儿子冬马在8年前坠崖，在这8年时间里他一直昏迷不醒。在母亲的照料下冬马终于醒了过来，但却丧失了记忆，不知道当时在自己身上发生了什么事情。柯南通过推理，认为冬马的坠崖与一系列的案件有关。

处于无政府状态的日本，受到了由超国家之间所组织成的名为“GHQ”的组织的武力介入并接受其统治，东京的六本木更成为被封锁的地区。之后又以名为“lost christmas（失落的圣诞）”的事件为契机，日本失去了独立国家的实质权力，并被赋予了表面上的自治权，由此人们开始享受短暂的和平。时光流逝，10年后的2039年。少年樱满集——怀抱着抑郁的心境，并对世间冷眼相待——在天王州第一高校就读的高中二年生，与同学们保持着一定距离的同时，度过着闲散而又平静的日子。然而集安稳的日常在某一天突然宣告结束。那天放学后，在自己中意的老地方和一名少女不期而遇。少女名为楪祈。她正是集所憧憬，并在网上有着巨大影响力的歌手。而她也有不为人知的一面。祈正是由17岁青少年恙...

故事是从一位大学生一一森里萤一的一通电话开始，萤一在不经意的情况下召唤了女神贝璐丹迪。贝露丹蒂要求萤一许一个愿望，萤一的一句半开玩笑的愿望「希望像你这样的女孩能够永远陪伴在身边」，结果竟然被受理，萤一和贝露丹迪只好同住在一个屋檐下，共同生活、共同享受爱情的快乐，而故事也此展开。在姐姐乌璐德、妹妹诗库璐德等女神及其他人物陆续登场下，整个故事也越来越有趣！

小美和父亲史诺顿博士在绿色原野过着相依为命的生活。某日，博士在偶然之中得到了一块神秘的木刻板，并因此惹祸上身下落不明，留下小美一人过着孤单的生活。小美于无意之中在木刻板上排列的文字，竟然幻化成为了强大的“未知图腾”，为了抚慰小美孤单的心灵，未知图腾制造了美满的幻境令小美深陷其中，随着时间的推移，小美曾经的家被结晶包围，成为了一座结晶塔，而小美的心也渐渐变为冰冷的结晶。 为了满足小美“想要妈妈”的愿望，未知图腾绑架了小智的妈妈困于结晶塔之中，迫使小智不得不踏上拯救妈妈的旅途，然而，小美的心智早已经被污染殆尽，在她的眼中，小智就是一心想要破坏她幸福生活的最险恶的敌人。

位于东京的东都线地铁开通当日，一起针对东京都知事朝仓优一郎的炸弹袭击事件爆发，导致东都线列车损毁。经过一番推理，江户川柯南等人认定这次的事件与8年前朝仓优一郎主持负责的北之泽水坝的修建有关。当年为了修建大坝，朝仓动员北之泽村的人民搬入新村，可是仍有许多人反抗到最后阶段不愿搬迁。为了探明事情的真相，柯南、灰原、少年侦探团以及毛利小五郎等人开车前往白雪皑皑的北之泽。在这片纯净的雪国，少年们尽情玩耍，与此同时他们也遇到了几名原北之泽村的村民，山尾、远野、立原等人。他们是从小一起长大的好朋友，而彼此之间似乎又有着某种芥蒂和秘密。立原的儿子冬马在8年前坠崖，在这8年时间里他一直昏迷不醒。在母亲的照料下冬马终于醒了过来，但却丧失了记忆，不知道当时在自己身上发生了什么事情。柯南通过推理，认为冬马的坠崖与一系列的案件有关。

在天下失序、列强割据的时代，僧人祥庵将一名孤儿从中国带到了日本。孤儿名叫仔太郎，他背负着一个惊人的秘密，中国的某武装组织追着他也到了日本。祥庵死后，孤苦无依的仔太郎带着爱犬飞丸前往赤池之国的万觉寺，在途中遇见了神秘剑士“无名”。仔太郎遭到追杀，危急时刻无名救了他一命。从此两人结伴同行。性格乖僻的浪人和紧闭心扉的少年虽然磕磕碰碰不断，但渐渐成了好朋友。白鸾率领的追杀组织还是抓住了仔太郎，他们开始着手筹备某种仪式。金发碧眼的剑士“罗狼”也是追杀组织中的一员，他虽然听命行事但并不真正在意组织的目的，对他来说，寻找可以与自己匹敌的对手才是生命的意义。而罗狼与无名之间的生死对决也拉开了帷幕……