在遥远的莱茵凡王国，王妃诞下了一对双胞胎，可是这对可怜的婴儿自打出生，就背负了残酷的命运。邪恶的教主预言，其中的女婴会在16岁之际成为毁灭世界的可怕存在，因此，刚刚出生的帕西菲卡卡尔苏就被下令处决。出于怜悯，帕西菲卡被一对夫妇收养，隐姓埋名的长大。在新家里，帕西菲卡认识了没有血缘关系的的哥哥夏浓卡尔苏和姐姐拉克薇尔卡尔苏，三人过着平静而快乐的生活。可是，命运不肯放过帕西菲卡，帕西菲卡依旧活着的消息走漏到了教会中，面对着接踵而来的杀手和人们的敌视，在哥哥的保护下，帕西菲卡踏上了逃亡的旅程。随着年龄的渐长，“废弃公主”毁灭世界的预言是否会成真？

一年一度的七夕即将到来，东京、神奈、静冈、长野等地却接连发生六起连环杀人案。被害者身边皆留下麻将牌中的七筒和奇怪暗示。由于案发范围过大，各地警署探员纷纷聚到东京警署的专案组共同研究案情，名侦探毛利小五郎也被邀请参加，江户川柯南则偷偷听取了会议的内容。会后，江户川柯南无意中听到群马县的山村操警官哼唱的童谣，继而发现有黑暗组织的成员混进警察中间。在一次围捕行动中，柯南遇到假扮人质的苦艾酒，得知近期一连串的杀人案件与存有组织内部人员资料的记忆卡有关。与此同时，潜入警察内部的间谍偷偷盗取工藤新一和柯南的指纹，新一的身份眼看就要被拆穿了，巨大的危险正向柯南和他身边的人急速袭来！意识到事情危险性的江户川柯南独自展开了调查……

4年前的"黄昏"事件告一段落之后，THE WORLD再次出现了神秘事件，而发生的一切，都与4年前的相似，受到玲奈的推动下，秀悟连说明书都没看就直接进入了THE WORLD。在对网络游戏发展惊讶之余，秀悟遇到了各种各样的角色。等到怜奈出现后，他们就开始了RPG游戏中最基本的工作--练级，而对限定角色产生兴趣的米蕾优，一直尾随他们来到了怪物平原。对于游戏经验不足的秀悟，很快就给打到重伤，幸好有怜奈的帮助，还是可以轻松地解决怪物。在玲奈的抱怨下，秀悟不得不翻开说明书。胸有成竹的秀悟再次上到战场，但不料竟遇到超强力怪物铠战将军。为了掩护怜奈逃跑，秀悟死在铠大将军手下。然而死后的秀悟发觉到身体不受控制。"你不可以死"迷之少女的神圣一吻，令秀悟复活了，并接受了黄金腕轮。清醒后发现怜奈被铠大将军追杀，而巴鲁蒙克也出现并试图阻止，但惊讶的发觉此铠大将军拥有不死身。在使用数据转换后，怜奈也得救了。在将铠战将军收拾后，米蕾优也露面了，但怜奈却拉着秀悟走了。另一方面，巴鲁蒙克也开始注意到事件的严重性。

在不久之前，市内发生了连环杀人事件，遇害人每一个都是音乐家，而且他们均出身于著名钢琴家领衔创建的一所音乐学院。江户川柯南、毛利小五郎、毛利兰、少年侦探团等一行人，收到了一位著名钢琴家的邀请，出席由他出资建造的音乐厅的落成典礼音乐会。该音乐会最大的亮点是巴赫弹奏过的管风琴、世界著名的斯特拉迪瓦里琴的音色，以及拥有绝对音感的天才歌手的歌声。可是万万没想到，在音乐会正式举办之前，陆续发生了许多可疑的案件，让每个人都忧心忡忡。而且，在音乐会正式开演当天，江户川柯南他们所在的音乐会会场突然发生了很大的爆炸，整个会场陷入一片火海之中。江户川柯南根据线索一步步地查明了几起案件的联系，并在最后找出了案件背后的真凶。

在东京某个位于西国立市的神社内，有三名可疑的男子正在密谈。突然有个戴着假面具的黑影男人出现，他用日本刀和弓箭在瞬间将三人杀害。与此同时，在大阪、京都也相继发生了杀人事件。警方在经过调查后发现，被杀害的五人都是出没于东京、大阪、京都三地，专门偷窃著名佛像及艺术品的窃盗集团“源氏萤”的成员。这个集团以日本历史上最有名的悲剧武将——源义经的故事《义经记》为名，首脑化名“义经”，部下则以“弁庆”为首，各自以家将姓名相称。另一方面，小五郎带着柯南、小兰和园子来到了京都。八年前，位于京都的古老寺院——山能寺中的一尊国宝级佛像遭到偷窃，寺院的住持为了解读一幅可以判断佛像藏匿地点的谜样的画像，因而请来了小五郎帮忙，小五郎一行人展开了调查。

2017年，世界最大规模的网游《The World R:2》享誉全球。被其魅力所吸引，某位17岁的高中生创建了一个名为“长谷雄”的角色进入游戏。但是与同学口中听说的世界不同，整个游戏此时到处充斥着任意PK的气氛，刚进入游戏的长谷雄便惨遭野外PK被杀，而复活他的是一位名为“Ovan”的玩家，公会《黄昏之旅团》的会长。在游戏中也颇为有名的Ovan在离开之前留下了一句“你非常有资质”的话，而与Ovan接触了的长谷雄也被游戏中的各方势力认为可能持有某种特殊的力量，对他的关注也日愈增加。而极度讨厌他人视线的长谷雄便独自一人前往野外练级，却又一次遭遇无端PK，危急时刻帮助他的，便是他生命中极为重要的女人“志乃”，身为“黄昏之旅团”副会长的她自称是前来将长谷雄带回了“黄昏之旅团”的，而此刻还在犹豫是否要加入知名公会“TaN”的长谷雄，在经历了一番曲折之后终于决定加入“黄昏之旅团”，而他的故事也正式开始。

最强战士贝利亚因为渴望力量偷取等离子火花塔而坠入黑暗，走上歧路的贝利亚发起了一场叛乱。最后还是奥特之王亲自出手才平定了这场叛乱，并将贝利亚打进宇宙监狱。多年以后，扎拉布星人拿着终极战斗仪在宇宙监狱救出了贝利亚。重获新生的贝利亚直接杀回光之国，以报当年被封印之仇。一场大战过后，贝利亚夺走了光之国的核心能源，最终导致奥特之星瞬间冻结。只有少数奥特战士得以成功逃离，剩下的奥特战士都被冻结在奥特之星上。梦比优斯奥特曼等少数逃出的奥特战士，肩负着光复光之国的使命。不过仅靠他们几位奥特战士的力量还不足以对抗邪恶的贝利亚，所以需要更多的力量才行。后来在对抗贝利亚的战斗中，赛文奥特曼陷入危机，其他奥特战士的情况也不容乐观。于是，赛文奥特曼发出了求救的飞镖。远在他乡修行的赛罗奥特曼，原本正在雷欧奥特曼的指导下，进行高强度训练。结果突然看到自己父亲的头镖飞了过来，在奥特之王的指引，赛罗奥特曼提前结束修行，火速赶往怪兽墓场，支援自己的父亲。

一天，宇宙开发中心的上空发现了来历不明的太空母舰，一名神秘女子出现，随后城市受到了外星机器人的袭击。高斯奥特曼及时出现打败了外星机器人，结果又出现了2台外星机器人，高斯陷入危机。武藏看到高斯陷入危险，主动与高斯合体，利用技能让2台外星机器人停止行动。就在此时杰斯提斯奥特曼忽然出现，他不但启动了两2台外星机器人，并且还和2台外星机器人联手杀死了高斯。这名神秘女子来到地球不是为了维持宇宙的秩序，而是要把地球上所有生物全部消灭！为了自救，世界各国想尽所有办法去解决眼前的危机。地球即将毁于一旦，大家没有一点办法，除非奇迹出现。然而，武藏的亲人和队友任坚信高斯和武藏还未死去，他们四处奔走寻找，希望奇迹真的能够出现！

在不久之前，市内发生了连环杀人事件，遇害人每一个都是音乐家，而且他们均出身于著名钢琴家领衔创建的一所音乐学院。江户川柯南、毛利小五郎、毛利兰、少年侦探团等一行人，收到了一位著名钢琴家的邀请，出席由他出资建造的音乐厅的落成典礼音乐会。该音乐会最大的亮点是巴赫弹奏过的管风琴、世界著名的斯特拉迪瓦里琴的音色，以及拥有绝对音感的天才歌手的歌声。可是万万没想到，在音乐会正式举办之前，陆续发生了许多可疑的案件，让每个人都忧心忡忡。而且，在音乐会正式开演当天，江户川柯南他们所在的音乐会会场突然发生了很大的爆炸，整个会场陷入一片火海之中。江户川柯南根据线索一步步地查明了几起案件的联系，并在最后找出了案件背后的真凶。

暗黑宇宙大皇帝安培拉星人为了再次进攻奥特之星，特意打造出了一套铠甲。这套铠甲拥有相当可怕的力量，只有像安培拉星人、贝利亚奥特曼这种拥有强大黑暗力量的外星人才能穿着。穿上这套铠甲的人，实力会增幅数十倍，其他人如果穿上这套铠甲，不光不能获得力量，反而会被铠甲所控制。安培拉星人死后，黑暗铠甲拥有属于自己的意识，在黑暗火焰（安培拉星人的宇宙船）的空间中出现。黑暗铠甲吞噬了希卡利并夺走了希卡利的意识，使希卡利变成了黑暗铠甲的傀儡，让地球再次出现了许多怪兽。后来，梦比优斯按希卡利之前教给他的办法，在GUYS队员的帮助下，让黑暗铠甲裂开了一条缝隙，希卡利借此得以脱身。脱身后希卡利和梦比优斯直接击碎了黑暗铠甲，没想到，破碎的黑暗铠甲居然再度复活了。一场恶战再次打响……

在不久的未来，世界已经被智脑公司所统治。世界上的大多数人类都被智脑公司变成了怪人“俄尔以诺”，残存下来的人类仅有2433人，他们组成反抗军，以女主角园田真理为中心，躲在角落里苟延残喘。而假面骑士555是人类的救世主，其变身者乾巧，在智脑公司发动的总攻下被打败，目前生死不明。智脑公司为了对付余下的假面骑士凯撒，开发出了最强的假面骑士腰带“帝王腰带”。面对利用帝王腰带变身的强大邪恶假面骑士，反抗军无力对抗。难道人类真的就要就此灭绝了吗？心灰意冷的园田真理在空无一人的舞会上独自落泪，就在这时她的背后出现了一个一身白衣的男子，真理从他身上隐约看到了乾巧的影子。没错，他就是丧失了记忆的乾巧。巧和真理的命运在这孤独的世界中会走向何方？人类的救世主传说就此展开！

故事以15年前的北大西洋上一件海难作序幕，这宗海难是由一艘在深夜浓雾中航行的货轮引起的。由于未能及时发现航道上有巨大冰山，货轮猛烈撞上冰山后导致引擎室受到重创，整艘船也在不久后彻底沉没。虽然大多数船员顺利获救，但船长与一名船员还是不幸罹难。而在15年后的东京大都会，大财团的著名设计师在驾车时，突然心脏病发作。连人带车冲向山谷，车子在坠落山谷后起火燃烧，设计师当场气绝身亡。这两宗分别发生于两个不同年代的意外居然是一场惊天大阴谋的序幕。幕后黑手选择了豪华邮轮“爱芙罗黛蒂号”作为展开阴谋的地点。恰巧江户川柯南、毛利兰、毛利小五郎等人参加了这艘邮轮的首次航行仪式，他们将一步步揭开幕后黑手的阴谋，让真相水落石出。

针对警察的连续杀人案件发生了，连续有两位东京警视厅的警察遇害了。柯南在街头目睹一名正打电话的警察在雨中被射杀，忙去追踪凶手，但凶手逃脱了。死者闭眼一刻紧抓左胸，似乎有所暗示。事后柯南从目暮警官口中了解到紧抓左胸是暗示那里有警察手册。不久又有警察手拿警察手册被人射杀于地下车库。对于这两起案件，目暮警官等人一反常态不愿向毛利小五郎及柯南透露太多信息。毛利小五郎不甘心进一步追问，白鸟警官只答一句“Need not to know”。该话是警察之间所用的密语，意味着这两起杀人事件与警察内部人士有关。 柯南、小兰等人参加白鸟妹妹的婚宴，但突然间停电了，那一刻小兰正与女警佐藤在洗手间。小兰拿起身边的手电筒欲照明时，一颗子弹射进佐藤身体，小兰吓昏过去。目暮见事态越来越严重，将秘密说出，原来死去的两名警察正与佐藤一起重查一桩有关医生仁野自杀的案件，该案涉及到警察局长的公子，事情越来越扑朔迷离。

只有午夜零时才能访问的“地狱通信”。如果在这里填写无法平息的怨恨的话，地狱少女将会出现，将你所怨恨之人打入地狱的深渊…在孩子之间广传的都市传说般的流言其实是真事。她的名字是，阎魔爱。

在小孩子之间,流传着一个传说，在深夜零时正，心怀怨恨的人就能够进入一个名为“地狱通信”的网页。在网页上打上怨恨之人的名字，名为阎魔爱的“地狱少女”就会显现于心怀怨恨者的身旁。地狱少女其后会交给对方一个颈部系有红线的稻草人，并说明契约方式和后果：只要解开红线，契约就会成立，地狱少女会将对方所怨恨者流放到地狱。但是，对方在解除怨恨后，亦要付出代价。对方决定把受诅人流放到地狱，自己在死后也要面对同一命运……至于是否要解开红线，完全是委托人的决定。“害人终害己。当对方下地狱的同时，你死后你的灵魂也会随之下地狱，即使这样你也愿意吗？”

21年前，在未爆炸弹事故中濒死负重伤的间黑男。在不屈的复健治疗中复活，现在作为天才外科医生“黑杰克”活跃在医学界。某天，没有音信的父亲突然出现了。舍弃了母亲和年幼的黑男的父亲在21年后再会。紧接着，黑杰克的家遭人爆破。不久后，黑杰克诞生的背后隐藏着冲击的事实变得明朗。动摇世界的巨大阴谋与他自身命运的战斗现在开始！